۳۰ دانشگاه علوم پزشکی برتر بر اساس رتبه بندی موسسه استنادی و پایش علم و فناوری جهان اسلام ISC – 1396 – 1397
در هز بازه‌ی رتبه‌ای اگر بیش از یک دانشگاه یا موسسه‌ی آموزش عالی وجود داشته باشد دانشگاه‌ها و مؤسسات آموزش عالی در آن بازه به‌ترتیب حروف الفبا فهرست شده‌اند.
| رتبه کل | نام دانشگاه |
| 1 | دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی تهران |
| 2 | دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی شهید بهشتی |
| 3 | دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی تبریز |
| 4 | دانشگاه علوم پزشکی مشهد |
| 5 | دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی شیراز |
| 6 | دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی استان اصفهان |
| 7 | دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی ایران |
| 8 | دانشگاه علوم بهزیستی و توانبخشی |
| 9 | دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی جندی شاپور اهواز |
| 10 | دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی مازندران |
| 11-15 | دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی البرز |
| 11-15 | دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی شهید صدوقی یزد |
| 11-15 | دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی کاشان |
| 11-15 | دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی کرمان |
| 11-15 | دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی کرمانشاه |
| 16-20 | دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی استان زنجان |
| 16-20 | دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی استان همدان |
| 16-20 | دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی بابل |
| 16-20 | دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی زاهدان |
| 16-20 | دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی کردستان |
| 21-30 | دانشگاه علوم پزشکی ارتش جمهوری اسلامی ایران |
| 21-30 | دانشگاه علوم پزشکی ارومیه |
| 21-30 | دانشگاه علوم پزشکی شهرکرد |
| 21-30 | دانشگاه علوم پزشکی گلستان |
| 21-30 | دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی اراک |
| 21-30 | دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی خراسان شمالی |
| 21-30 | دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی رفسنجان |
| 21-30 | دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی قزوین |
| 21-30 | دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی قم |
| 21-30 | دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی گیلان |
